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HTH (helix turn helix) domain
GEF (guanine-nucleotide-exchange-factor)domain
NLS domain
SDM (SAM-dependent O-methyltransferase motif)domain
請問這些domain有什麼作用
其motif 又是指什麼?
我不是很清楚~有人可以幫助我嗎?
謝謝








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有關domain及motif間的差異,請看我在教學網的生化論壇上post的另一篇文章。


請到http://www.e-biolearning.com/bbs/ 點選研究所生化,出來的文章很多,


你要瀏覽一下,找尋『蛋白質的domain與motif有什麼不同?』一文,我就不重覆敘述了。


1. Helix-turn-helix (HTH) domain:是DNA結合蛋白中,常見的結構之一。


例如:胚胎發育時決定器官形成的Homeobox domain即是。


2. Guanine-nucleotide exchange factor (GEF) domain


是提供GDP與GTP交換的功能單位。


例如:eIF2B即為guanine-nucleotide exchange factor,可將eIF2-GDP再生為eIF2-GTP。


[註]:eIF2是真核細胞轉譯起始的蛋白質。


3. nuclear localization signal (NLS) domain


例如 NF-κB (是一種nuclear transcription factor)被活化後進入細胞核內,協助基因的轉錄。


NF-κB具有一段short internal basic sequence (稱為NLS domain),


可使NF-κB附著於核膜上而引導其進入細胞核內。


4. SAM-dependent O-methyltransferase (SDM) domain


顯然是將SAM上的甲基單位轉移到接受者-OH基的活性所在。


例如:由 norepinephrine甲基化形成epinephrine時,


該酵素的 SDM domain可辨識SAM的甲基而轉移到norepinephrine上。


[以上各舉一例說明該domain的功能]


Dr. 陳皓




參考資料
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